裴矩字弘大，是河东闻喜人。
祖父裴他，曾任魏国都官尚书。
父亲裴讷之，曾任北齐太子舍人。
裴矩在襁褓中就成了孤儿，到长大成一人，勤奋好学，很一爱一好写文章，有聪明才智。
伯父裴让之对他说：“看你超凡的才识，足以成为人才，但是要求得为官显达，还应学习一些处理世事的学问。”裴矩开始留心当时的政事。
北齐北平王高贞做司州牧，征召裴矩做兵曹从事，随后，又转任高平王文学从事。
直到北齐灭亡，裴矩都没有得到调迁。
高祖做定州总管，召来裴矩并授给他记室职务，很亲近尊重他。
后来，裴矩因母亲去世离了职。
高祖做国相后，派使者骑快马召来裴矩，让他参与相府记室事务。
到高祖受禅得到皇位，他又迁升为给事郎，掌管舍人要事。
在讨伐陈的战事中，他又兼任元帅记室。
隋军已经攻破丹一陽一，晋王杨广让裴矩同高赹收集陈国的地图和户籍。
次年，奉诏巡抚岭南，还没起程，就遇上高智慧、汪文进等聚众作乱，吴、越一带道路被堵塞，皇上难以派遣裴矩前去。
裴矩请求迅速出发，皇上同意了。
走到南康，获得数千兵卒。
当时，俚人的元帅王仲宣一逼一进广州，并派遣部将周师举围攻东衡州。
裴矩同大将军鹿愿赶到那里，贼军已经设置了很多栅栏，兵马驻扎在大庾岭，互为援助。
裴矩进兵攻破敌人，贼军害怕，就放弃了东衡州，占据原长岭。
裴矩又进兵攻破原长岭，于是斩周师举。
接着，他又从南海发兵援助广州。
王仲宣因害怕就溃逃了。
裴矩安一抚的地区有二十多个州，又按隋朝制度设置官职，安排那些首领任刺史、县令。
等到回报皇上，皇上非常高兴，让他上殿慰劳他。
皇上对高赹、杨素说：“韦氵光率领二万士兵，不能早过庾岭，我还时时担心他的兵少。
裴矩凭借三千残破之兵，一直打到南康，有像这样的臣子，我还有什么忧虑的呢！”裴矩因功被授为开府，赐封为闻喜县公，得赏布帛二千段。
后来，又被授为民部侍郎，接着又迁升为内史侍郎。
当时，突厥很强盛，都蓝可汗的妻子大义公主，就是北周宇文氏之女，因此多次制造边患。
后因大义公主同随从的胡人私通，长孙晟先揭发这件事。
裴矩请求出使，劝说都蓝可汗公开惩治大义公主。
皇上同意了他的请求。
果然像裴矩说的那样，大义公主被杀。
后来，都蓝可汗与突利可汗勾结作难，多次侵犯亭障，皇上命令太平公史万岁任行军总管，出兵定襄，命令裴矩做行军长史，在塞外攻破达头可汗。
史万岁被杀，裴矩的战绩竟未被叙录。
皇上因为启民可汗刚刚归附，就命令裴矩抚一慰他，回京后裴矩任尚书左丞。
那年，文献皇后去世，太常卿不知道礼节制度，裴矩和牛弘参照《齐礼》制定殡葬礼仪。
转任吏部侍郎，有称职之名。
炀帝即皇位，要在洛一陽一建造东都，裴矩任修府省，九十天就完成了。
当时，西域各蕃邦大多到张掖同中原往来通商。
炀帝命令裴矩掌管那里的事务。
裴矩了解炀帝正努力经营远方的谋划，于是，对那些到张掖来一经商的胡人，裴矩就引一诱他们，让他们说出自己国家的风俗习惯和山川险要，撰写了《西域图记》三卷，回朝把它上奏给朝廷。
其序说：我听说夏禹平定九州恶水，疏导黄河没有超越积石，强秦兼并六国，设防御也只到达临洮。
故知西域蕃胡种族混杂，居住地方偏远，是礼仪教化不容易到达，典章文化很少传播到的地方。
自从汉朝兴起，开拓黄河以西地区，才开始有名称的，有三十六个国家，那以后又分崩离析，这才有五十五个国王。
那时，仍然设置校尉、都护等官职，以便存恤招抚。
然而，那些胡人时而归顺时而背叛反复无常，屡屡经过战争。
到了后汉，才逐步废了这些官职。
虽然自大宛以来，还略略知道人户的多少，但是各国的山川地域没有名目。
至于那些姓氏风俗、服饰物产，全无编纂记载，所以世上没听说过。
又因朝代的更替，时代相隔久远，讨伐兼并，有的兴，有的亡。
有的地方原是旧的种族，却又用现在的称号，有的人不属原来的氏族，却又沿袭往时的名称。
加上部落百姓交错居住，疆界改变，戎人狄人语言不同，情况实在是难以全部验实。
于阗之北、葱岭以东地区，从前朝史书中考证，有三十多个国家。
后来又遭陷没，仅有十个存在。
其他被消灭俱尽，空有废墟的，就无法记载了。
皇上膺受天命，化育万物，不让华夏和四夷隔绝，四海之内百姓，没有不仰慕教化的。
凡是风吹到的地方，太一陽一能照临的地方，各地赋税贡献全都到了朝廷，不管多远没有不到达的。
我既然抚纳了他们，观察了解边关要塞的贸易情况，寻找探索书传，采访胡人，对有些有怀疑的事情，我就广泛听取镑自不同的说法，按照他们本国的服饰仪态，从国王到一般百姓，表现出他们各自不同的形貌举止，又即刻用丹青摹仿勾画出，写成《西域图记》，一共是三卷，记有四十四个国家。
又另画地图，画出其要害，从西顷以远，到北海之南，纵横绵延，将近二万里。
我推想这里从来就是富商大贾周游经过的地方，所以，对各国情况没有不普遍了解的。
还有一些地方，因地荒路远，仓猝寻访，还很难一下弄明白，但是又不能凭空虚造，因此缺如。
而两汉相继立国，西域作为驿舍，几十户百姓就称一个国家，有名号，名不符实。
现在编入户册的，都有千多户，他们利尽西海，多产珍贵奇异之物。
那些在山里居住的人们，没有国名，至于那些小的部落，大多也没有记载。
从敦煌出发，到达西海，共有三条路，各条路又有它的路线。
北道从伊吾，经过蒲类海铁勒部，突厥可汗处，渡过北流河水，到拂艹林国，到达西海。
那中道从高昌、焉耆、龟兹、疏勒，越过葱岭，又经过钅发汗、苏对沙那国、康国、曹国、何国、大安国、小安国、穆国，到波斯，最后到达西海。
那南道从鄯善、于阗、朱俱波、喝般木陀，过葱岭，再经过护密、吐火罗、挹怛、忄凡延、漕国，到北婆罗门，最后到达西海。
三条路上的各个国家，也各有各的路，南北往来通达。
那东女国、南婆罗门国等，如果一齐顺着要去的地方前行，各处都能通达。
所以了解到伊吾、高昌、鄯善都是西域的大门户，全都汇合到敦煌，是西域的咽喉之地。
凭借国家的威望和恩德，将士的勇一猛雄健，旌旗一举则能渡过氵蒙汜，战马腾跃能跨过昆仑，像翻一下手掌那样容易，哪里不能到达呢！只是突厥、吐谷浑分别管辖羌族和匈奴，成为那里的障碍，所以给朝廷贡献的物品不能到达。
现在又因为西域商人秘密送来财物，盼望归附朝廷，愿意作臣子。
圣上福泽给养人类，恩惠普及天下，如果使他们信服，让他们得到抚恤，那么就一定能归顺安定。
所以，皇上派遣使者，不要发动战事。
只要各蕃邦归顺，吐谷浑和突厥也就能够消灭。
我朝统一四夷和华夏，大概就在此时了！如果不记载什么情况，就无以表达皇上声威教化的深远。
炀帝看后非常高兴，赏给裴矩布帛五百段。
每天召裴矩到殿上侍坐，亲自询问西域的情况。
裴矩盛赞胡蕃中有很多珍宝，吐谷浑容易并吞。
炀帝因此很快意，将沟通西域，经营四方的重任全都委派给裴矩。
裴矩转任民部侍郎，还没开始办事，就又调迁黄门侍郎。
炀帝又命令裴矩前往张掖，引导西域蕃邦入朝贡献，到朝廷贡献土产的有十多个国家。
大业三年(607)，炀帝到恒岳祭祀，这十几国都来助祭。
炀帝将要巡视黄河以西地区，又命令裴矩前往敦煌。
裴矩派使者劝说高昌王曲伯雅和伊吾的吐屯设等，用丰厚的利益好处来引一诱他们，让他们入朝。
到炀帝西巡，驻扎在燕支山时，那高昌王、伊吾设等人和西蕃的二十七国国主，都到道路左边拜见炀帝。
炀帝让他们都佩金玉，披锦缎，焚香奏乐，歌舞喧哗。
又让武威、张掖等郡的官家女子穿着盛装跟随观看，车马堵塞，绵延十多里，来显示中原的强盛。
炀帝看到这情景，非常高兴。
隋军终于击败了吐谷浑，扩展疆土数千里，朝廷都派兵把守，每年输出的物产以亿万计。
各蕃邦害怕，来朝廷上贡的络绎不绝。
炀帝认为裴矩有安一抚民心的才略，提升他为银青光禄大夫。
那年冬天，炀帝到东都，裴矩因前来朝贡的蛮人夷人，就劝谏炀帝命令都府大演百戏，召集天下奇怪的技艺，排列在端门街。
当时，身穿锦绮、披金戴银的人达十多万。
炀帝又命令文武百官和平民百姓列坐棚阁任意观看。
人们都披着色彩鲜丽的衣服，一月之后才结束。
炀帝又命令丰都、大同、通远三市饮食店都设置帷帐，摆着丰盛的酒席，并且派掌管蕃邦的官员带领那些蛮夷商民与汉民贸易交往，凡是蕃民到达的地方，店肆就把他们全部邀请入席，让他们喝醉吃饱才离开。
那些蛮夷赞叹不已，称中原是神仙之地。
炀帝赞赏裴矩的挚诚，回头对宇文述、牛弘说：“裴矩很理解我的心意。
凡是呈奏的事情，都是我做了打算的事，我还没有宣布的时候，裴矩就已经说出来了。
假如不是尽心奉国，哪能像这样呢？”炀帝派将军薛世雄在伊吾建造城市，命令裴矩一同前往西域经营策划。
裴矩讽谏西域各国说：“天子觉得蕃人贸易经商相距太远，所以才在伊吾建造城市。”蕃人都认为是这样，也就不再来干扰。
裴矩回到朝廷，炀帝赏给他钱四十万。
裴矩又上奏皇上，请求让他用反间计，让射匮秘密进攻处罗，这些话记载在《西突厥传》里。
后来，处罗被射匮一逼一迫，终于随使者入朝进见。
炀帝非常高兴，拿豹皮和西域珍宝赏给裴矩。
裴矩随从炀帝到塞北巡视，炀帝驾莅启民可汗帐篷。
那时，高丽已先派使者与突厥沟通，启民不敢隐瞒，便带领高丽使者前来拜见炀帝。
裴矩于是上奏皇上说：“高丽这地方，本来是孤竹国，周代把它封给箕子，汉代又把它分为三个郡，晋代也统辖辽东。
现在竟然不称臣，另为外域。
所以先帝对它很憎恨，要讨伐它也很久了。
只是因为杨谅无能，发兵征讨没有结果，陛下在这个时候，怎么能不成就大业，让这文明之地仍为蛮夷之乡呢？现在，高丽的使者向突厥朝拜，拜见启民，他们全国百姓顺从归化，高丽一定害怕皇上的神通广大，考虑到后降伏的要先灭亡。
如果强迫他们入朝，应该是能达到目的的。”炀帝问道：“怎么办？”裴矩回答说：“请让我当面告诫使者，放他们回到自己的国家，派他们告诉他们的国王，命令他们的国王迅速来朝廷进见。
如果不这样的话，就要带领突厥，马上除掉他们。”炀帝听取了这个建议。
后来，因为高元不听命，才考虑征讨辽东的策略。
军队到辽东，裴矩以本官身份兼任武贲郎将。
第二年，他又随军队来到辽东。
后来，兵部侍郎斛斯政逃到高丽，炀帝命令裴矩兼管军队事务。
因为裴矩前后到辽参战，又被迁升为右光禄大夫。
在当时，朝廷纲纪不振，人们都改变了节一操一。
左翊卫大将军宇文述，内史侍郎虞世基等滥用职权，徇私枉法，文武百官也多因行一贿受赂而闻名，只有裴矩还保持原来的节一操一，没有贪赃枉法的名声，因此，被人们称颂。
裴矩回到涿郡，炀帝因刚刚平定杨玄感叛军，命令裴矩安一抚陇西一带。
裴矩因此到会宁，抚一慰曷萨那部落，派阙达度设一騷一扰吐谷浑，常有俘虏劫获，部落渐渐富裕。
裴矩回到朝廷，上奏炀帝，炀帝很赞赏。
后来裴矩随军队到怀远镇，炀帝命令他总管北蕃军事要务。
裴矩因始毕可汗部落逐日强大，就向炀帝献计分散突厥势力，要把王室女儿嫁给始毕弟弟叱吉设，并授叱吉设为南面可汗。
叱吉设不敢接受，始毕听到这件事后，就逐渐产生怨恨。
裴矩又对炀帝说：“突厥本来就淳朴，容易离间，只是由于他们内部多有群胡，又全都凶狠狡猾，把突厥人教坏了。
我听说史蜀胡悉最多一奸一诈诡计，受始毕一宠一信，请让我诱杀他。”炀帝说：“好。”裴矩于是就派人告诉胡悉说：“皇上现在在马邑大摆奇珍异物，要供蕃内贸易交换，如果先来，就能换得上等物品。”胡悉贪图好处，就相信了这话，没告诉始毕，就带领他的部落，赶着六畜，连夜急驰，争先恐后，希望能最先交易。
裴矩在马邑埋伏军队，引一诱他于是杀了他。
炀帝告诉始毕说：“史蜀胡悉突然带领部落人马来到我这里，说是要背叛可汗，请求我收容他。
突厥已经是我的臣子，那里有叛臣，我们应当协同处治。
现在已经杀了他，因此让人前往相告。”始毕知道其中情况，因此不入朝。
大业十一年(615)，炀帝到北方狩猎，始毕带领数十万骑兵，在雁门围困炀帝。
炀帝命令裴矩和虞世基每天住在大堂，以便咨询。
到解除雁门的包围，裴矩随从炀帝到东都。
射匮可汗派他兄弟之子带领西蕃诸胡来朝廷进贡，炀帝命裴矩设宴接待他们。
不久，裴矩随从炀帝驾临江都宫。
当时，四方叛军蜂拥而起，郡县上奏作乱之事不可胜数。
裴矩把这情况告诉炀帝，炀帝很气愤，派裴矩到京师接待蕃客，裴矩因病就没有去。
到义军入关之时，炀帝命令虞世基到裴矩住舍询问对策。
裴矩说：“太原已有变化，京城又不安宁，相隔遥远作出处理，恐怕失去机会，希望皇上早点从江淮回京都，才能平定事态。”裴矩又复出管事。
不久，骁卫大将军屈突通兵败的消息传来，裴矩把这件事告诉炀帝，炀帝脸色剧变。
裴矩平时勤勉谨慎，没有触犯他人的事，又见天下正处于混乱，怕造成杀身之祸，于是，他对待别人，大多超过那些人所希望得到的，所以，即使是服劳役的下人，他都能得到他们欢心。
当时，跟从炀帝的骁勇之士，大多数都已逃亡，炀帝担心这事，就询问裴矩，裴矩回答说：“现在，皇上滞留这里，已经两年了。
这些骁勇之士都没有家室，人没有妻偶，就不能长时间安居，我请求让士兵在这里成家。”炀帝听了非常高兴，说：“你必定多智谋，这是个妙计啊。”于是，炀帝就命令裴矩核实将士情况，给将士们娶妻室。
裴矩召集江都境内寡一妇和未出嫁的女子，把她们都集中在宫监之中，又召来将帅以及兵众任凭他们挑选。
让她们自首，让那些先前就已与人通一奸一的妇女和尼姑、女道士等，也都配人。
因此，骁勇之士都高兴，都相互称道说：“这是裴公的恩惠啊。”在宇文化及叛乱之时，裴矩早晨起来将去上朝，走到坊门，遇到几个叛逆一党一徒，他们挟持裴矩的马到孟景的住处去。
叛军都说：“这不与裴黄门相关。”一会儿，宇文化及带领百多人马到来，裴矩相迎拜见，化及安慰谕示他。
化及命令裴矩参照制度，推举炀帝侄子秦王杨浩做皇帝，授裴矩为侍内，随宇文化及到黄河以北。
宇文化及僭越皇位，将裴矩迁升为尚书右仆射，加任光禄大夫，封为蔡国公，任河北道安一抚大使。
宇文化及失败，裴矩被窦建德俘获。
因为裴矩是隋朝老臣，窦建德待他很优厚。
又任裴矩为吏部尚书，接着又迁职为尚书右仆射，专管铨选之事。
由于窦建德出身于群盗，没有礼节，裴矩替他制定朝纲制度。
十月之间，典章法度就已经很齐备，就像君王一样。
窦建德非常高兴，经常向裴矩询问要事。
窦建德渡黄河讨伐孟海公，裴矩同曹旦等留在氵名州留守。
窦建德在武牢兵败，将帅不知归从哪里，曹旦长史李公淹、大唐使人魏征等人归劝曹旦和齐善行归顺大唐。
曹旦等人听从了他们的劝告，于是就让裴矩把八枚传国玉玺，给魏征和李公淹，将崤山以东的土地全部归顺到大唐。
裴矩被授为左庶子，后转任詹事、民部尚书。