临十床十症状多为非特异十性十，常可遇到与其它原因引起的症状相似，必须加以鉴别。核黄素缺乏十性十陰十囊皮炎易和慢十性十陰十囊湿疹相混淆是相混。后者常单独发生，病程较长，往往开始即为一片湿疹，与膳食历史无关。而十陰十囊皮炎，多为集体发生，常于短期内大批发病。其发病常与膳食中核黄素供给量、烹调方法和劳动强度等有关。检查时可见到十陰十囊中缝(scrofal raphe)皮肤正常，同时可能在口腔、眼睛和皮肤等处有核黄素缺乏症状，可资鉴别。必要时可做核黄素试验治疗或真菌培养。角膜血管形成需与沙眼十性十血管翳鉴别。沙眼十性十血管翳开始于角膜上缘，自上而下呈悬帘状，新生血管前端，多停留在同一水平线上；核黄素缺乏的角膜血管形成则血管自角膜缘四周同时伸十入角膜，与沙眼十性十血管翳完全不同。此外还应仔细寻找有无继发十性十原因，如某些疾病使吸收、利用障碍或需要量增高，为明确诊断，有时需做治疗试验。患者给予核黄素后，怕光、流泪和眼烧灼感症状，大约在24～72小时内消失。结膜充十血和角膜血管形成数日内消失，皮肤损害和舌十尖反应较慢、但一般1～2周内有明显好转。
有条件可做实验室检查。血浆游离核内素、FAD、FMN和白细胞游离核黄素均较恒定，无诊断价值。红细胞核黄素含量的变化和膳食摄取量有密切相关，但测定较复杂，故少采用。一般多测定尿中排十出量，作为诊断依据。
收集尿样的方法很多，常用的有以下几种：24h尿样能较准确的查明每天经肾排十出的核黄素量，是比较好的评价方法，但该法难以做到，收集的尿样也不易完整。为方便起见，可收集空腹1h尿，同样可以反映机体营养状况。据侯祥川报道，我国正常人平均每日核黄素排十出量为147.5～186.1g。空腹一小时尿核黄素排十出标准，可按24小时尿折算。另一法是收集任意尿样，用每克肌酐表示尿中核黄素排十出量，此法可以纠正受试者体重差异的影响，而且简便易行，现场工作多采用。负荷试验是反映体内维生素饱和程度的方法，测定一次给予大剂量核黄素后的排十出量。由于给药的方法、剂量和收尿的时间不同，负荷试验有多种，最常用的是口服核黄素5mg后，收集4小时尿样，则定其排十出量。
近年来，Glatyle和Bamji等研究一项新的评价方法，即用红细胞谷胱甘肽还原酶(erythrocyte glutathion reductase)(EGR)的活十性十系数(activitycoefficient)(AC)，简称EGR的AC值，来评价核黄素营养状况。EGR是一个以FAD为辅基的黄素蛋白，核黄素缺乏时酶活十性十降低，如在体外把FAD加入含谷胱甘肽还原酶的红细胞溶血液中，则酶活十性十可增强。增强后与原有活十性十之比值称为EGR的AC值。机体缺乏核黄素时AC值增高，补充核黄素后即下降。凡AC值大于1.20者，即认为核黄素营养不十良。顾景范曾对该法进行了动物及人十体试验，肯定了该法灵敏、准确、简便、能反应核黄素代谢状况等优点，并对测定方法进行了改进，使之适用于基层单位。
核黄素状态的评价标准
| 缺乏 | 不足 | 正常 | 充裕 | 测定者 | |
| μg·24h尿-1 | ＜100 | 100～199 | 200～399 | ＞400 | 王成发 |
| μg·24h尿-1 | ＜40 | 40～119 | 120～400 | ＞400 | Sauberlich |
| μg·g肌酐-1 | ＜27 | 27～79 | 80～170 | ＞270 | Sauberlich |
| μg·4g负荷尿-1 | ＜400 | 400～799 | 800～1300 | ＞1300 | 陈学存 |
| （口服VB25mg） | ＜500 | 王成发 | |||
| 100mlRBC-1 | ＜10 | 10～14.9 | ≥15 | ＞1300 | Sauberlich |
| EGR的AC值 | ＞1.4 | 1.2～1.4 | ＜1.2 | — | Sauberlich |